Самарская область - сильноосвоенный регион с типичными для европейской части РФ проблемами сохранения биоразнообразия. Природные территории образуют архипелаг островов в агро (урбо-) ландшафте (карта экологического каркаса Самарской области). Сохранение оставшихся островков дикой природы немыслимо без адекватной правовой защиты в форме особо-охраняемых природных территорий (ООПТ). В настоящий момент существует несколько десятков проектов памятников природы и заказников, подготовленных ЦС «ВУЭС» в разные годы и согласованных на местном уровне. Поскольку на областном уровне не принято решение об их утверждении, данные территории находятся под угрозой уничтожения (или уже уничтожаются).

Инвентаризация существующих памятников природы Самарской области. Точная привязка границ памятников природы к географическим и хозяйственным картам и схемам. Оформление документации на данные особо-охраняемые природные территории (ООПТ) в соответствии с формой Кадастра ООПТ, подготовка проектов властных решений по уточнению границ.

Оформление предложений по созданию новых ООПТ Самарской области. В том числе: памятников природы и заказников «Черемшан», «Сускан», «Байтуган», «Синий Сырт», «Майтуга» и др.

Доработка проекта системы ООПТ, интеграция его в систему управления природными ресурсами, территориального планирования, и принятия решений.

Проект «Возвращение Волго-Уральских орлов». Биотехнические мероприятия, направленные на увеличение численности хищных птиц Самарской области.