Наиболее значимой узловой территорией экосекции является степной массив "Таштугайская степь (245)", расположенная на границе с Оренбургской и Челябинской областью. Подробное описание дан-ной территории мы приводим ниже. В южной части экосекции выделены узловые территории, в границах очагов биоразнообразия и хорошо сохранившихся участков степи: "Ильячевская степь (248)", "Гора Хает (252)", "Степной комплекс у с.Первомайское (251)", "Гора Бирсалган (45)", "Гора Гулькулю-тау (44)".

В центральной и северной части экосекции как узловые территории выделены зауральские степные озера и водно-болотные комплексы. В состав узлов входят очаги биоразнообразия, формирующиеся в месте контакта степных и прибрежных водно-болотных экосистем, а так же акватория озер с прибрежными тростниковыми займищами как местообитание особых видов. К таким узлам относятся: "Озеро Султанкуль (10)", "Озеро Лебяжье (15)", "Озеро Юмаркалы (253)", "Озеро Аккуль (254)", "Озеро Мулдак-Куль (6)", "Оз.Улянды (13)", "Оз.Южные Улянды (21)", "Оз. Северные Улянды (20)", "Оз. Малые Улянды (5)", "Оз.Уляндыкуль (47)", "Озера Камышкуль и Юзейкуль (17)".

Узловой территорией является переходное болото - "Болото Тумарбаш (3)" и уникальный очаг биоразнообразия "Урочище Сускахаз (Баимовские поля) (4)".

Зоной связанности в Экосекции степного Зауралья является Таналыкская зона связанности - обширный массив, состоящий из мозаики небольших степных участков, старых залежей, байрачных лесков и водотоков, соединяющий узловые территории экорегионального значения в Таштугайском массиве и хребте Ирендык.

В пределах Экосекции степного Зауралья существует 2 памятника природы, относящихся к сохранению биоразнообразия. Памятник природы "Озеро Мулдак-Куль" защищает одноименную узловую территорию, а памятник природы "Восточный берег оз.Улянды" - около 10% узловой территории "Оз.Улянды". Остальные 21 узловая территория не имеет в своих границах утвержденных ООПТ. Таким образом, в пределах экосекции из 23471 га узловых территорий защищено ООПТ на площади 579 га (2,5%).

Таналыкская зона связанности не имеет никакого режима территориальной охраны. Для сохранения данной территории требуется оптимизация пастбищной нагрузки. Также желательно максимально расширить площади пастбищ за счет сокращения пашни.